Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD1AQ9Y241 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIGD1AQ9Y241 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms