Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC3Q9UQE7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms