Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SHOC2Q9UQ13 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHOC2Q9UQ13 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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