Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDZRN3Q9UPQ7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PDZRN3Q9UPQ7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms