Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAF8Q9UPN6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms