Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
L1RE1Q9UN81 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
L1RE1Q9UN81 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms