Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLEC4EQ9ULY5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLEC4EQ9ULY5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms