Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CROTQ9UKG9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CROTQ9UKG9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms