Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP21Q9UK80 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP21Q9UK80 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP21Q9UK80 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP21Q9UK80 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
USP21Q9UK80 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP21Q9UK80 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP21Q9UK80 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
USP21Q9UK80 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP21Q9UK80 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP21Q9UK80 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP21Q9UK80 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP21Q9UK80 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP21Q9UK80 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP21Q9UK80 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP21Q9UK80 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP21Q9UK80 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP21Q9UK80 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP21Q9UK80 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP21Q9UK80 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP21Q9UK80 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP21Q9UK80 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP21Q9UK80 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP21Q9UK80 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP21Q9UK80 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP21Q9UK80 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP21Q9UK80 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP21Q9UK80 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP21Q9UK80 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP21Q9UK80 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP21Q9UK80 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP21Q9UK80 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
USP21Q9UK80 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP21Q9UK80 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP21Q9UK80 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP21Q9UK80 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP21Q9UK80 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP21Q9UK80 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms