Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBE1Q9UJT0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms