Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJC5

SH3BGRL2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL2Q9UJC5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BGRL2Q9UJC5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms