Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCSK1NQ9UHG2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms