Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO40Q9UH90 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms