Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAE1Q9UBE0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms