Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MBD2Q9UBB5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms