Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL13Q9P2N7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms