Protein–RNA interactions for Protein: Q9P217

ZSWIM5, Zinc finger SWIM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM5Q9P217 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZSWIM5Q9P217 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM5Q9P217 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM5Q9P217 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM5Q9P217 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM5Q9P217 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM5Q9P217 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZSWIM5Q9P217 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms