Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CWC15Q9P013 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CWC15Q9P013 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms