Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EHD2Q9NZN4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms