Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2AIPQ9NXV6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2AIPQ9NXV6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms