Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TDP1Q9NUW8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TDP1Q9NUW8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDP1Q9NUW8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDP1Q9NUW8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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