Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms