Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
MBNL3Q9NUK0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MBNL3Q9NUK0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms