Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PKDREJQ9NTG1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PKDREJQ9NTG1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms