Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAMSN1Q9NSI8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMSN1Q9NSI8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms