Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MEPEQ9NQ76 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MEPEQ9NQ76 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms