Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4BQ9NPR2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms