Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IL1RAPQ9NPH3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
IL1RAPQ9NPH3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms