Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAT1LQ9HCJ6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms