Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPM3Q9HCF6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPM3Q9HCF6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPM3Q9HCF6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPM3Q9HCF6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPM3Q9HCF6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRPM3Q9HCF6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM3Q9HCF6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM3Q9HCF6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM3Q9HCF6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM3Q9HCF6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM3Q9HCF6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM3Q9HCF6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM3Q9HCF6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM3Q9HCF6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRPM3Q9HCF6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRPM3Q9HCF6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms