Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY9Q9HBG7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LY9Q9HBG7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms