Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVMER34-1Q9H9K5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVMER34-1Q9H9K5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVMER34-1Q9H9K5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVMER34-1Q9H9K5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVMER34-1Q9H9K5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVMER34-1Q9H9K5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVMER34-1Q9H9K5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms