Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TDRD3Q9H7E2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TDRD3Q9H7E2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms