Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNCQ9H7C4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms