Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC86Q9H6F5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms