Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCBP2Q9H190 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms