Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMG9Q9H0W8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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