Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRIM8Q9BZR9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRIM8Q9BZR9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms