Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP3-1Q9BYR8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms