Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GSDMCQ9BYG8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GSDMCQ9BYG8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms