Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VN1R3Q9BXE9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms