Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL3Q9BXA9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms