Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYCP2Q9BX26 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYCP2Q9BX26 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms