Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM175Q9BSA9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms