Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
FYCO1Q9BQS8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FYCO1Q9BQS8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms