Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
DDX50Q9BQ39 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDX50Q9BQ39 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms