Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VGLL1Q99990 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VGLL1Q99990 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms