Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARID3AQ99856 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms