Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSG101Q99816 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSG101Q99816 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms