Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHP1Q99653 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHP1Q99653 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms